Los poseedores de un GameBoy pueden disfrutar de una variante de Pokémon Puzzle League en la consola, llamada Pokemon Puzzle Challenge.
Esencialmente similar a la versión de Nintendo 64, carece del modo puzzle 3D por las limitaciones del hardware del GB. Entre los muchos modos de juego disponibles, destaca el modo "aventura"; donde deberemos batallar con los Lideres de gimnasio y la Elite Cuatro de Johto, con la posibilidad de encontrar muchos Pokémon secretos para jugar.
| Pokémon Puzzle Challenge | |
|---|---|
| Año de creación: | 2000 |
| Desarrollador: | Game Freak - Creatures - Nintendo - Intelligent Systems |
| Sistema: | Nintendo GameBoy Color |
| Tipo de juego: | Arcade - Puzzle estilo Tetris. |
| Idioma: | Japonés, Inglés, Español, entre otros. |
| Jugadores: | Uno o dos (con Cable Link) |